Bakterielles Vollgenom-Sequenzierung
Die bakterielle Vollgenom-Sequenzierung ist ein fortschrittliches Laborverfahren, das die gesamte genetische Information eines Bakterienstamms analysiert, um Infektionen präzise zu diagnostizieren und zu behandeln.
{"Die Methode liest die komplette Bakterien-DNA aus einer Kultursequenz","Sie identifiziert Resistenzgene und Virulenzfaktoren genau","Die Ergebnisse helfen Ärzten bei der Wahl des wirksamsten Antibiotikums","Sie kann outbreakartige Infektionen nachverfolgen und zuordnen","Das Verfahren ist besonders nützlich bei komplizierten oder chronischen Infektionen"}
Wichtigste Fakten im Überblick
- LOINC
- 90246-0
- Kurzcode
- BACWGS
- Synonyme
- Bacterial whole genome Islt-Seq
- Kategorie
- Klinische Chemie
- Probe
- whole-blood
- Probenbehälter
- Pure culture isolate on solid agar plate (e.g., blood agar, chocolate agar, MacConkey agar, tryptic soy agar) or in liquid broth (e.g., thioglycollate, brain heart infusion). Isolates should be submitted on appropriate transport medium in leak-proof, biohazard-compliant container (Category B shipping per IATA regulations).
- Einheiten
- N/A
- Nüchtern
- Nein
- Population
- Erwachsene
- Geschlecht
- all
- Altersbereich
- 0–120 Jahre
- Methode
- sequencing
- CPT
- 87900
- SNOMED
- 44750004
- Probenvolumen
- A visible pure colony or loopful of organism (approximately 10^6 to 10^8 CFU) from a fresh culture (18-24 hours growth); minimum one isolated colony required. For liquid media, minimum 1 mL of turbid broth culture.
- Probenstabilität
- Room temperature: viable for up to 7 days on appropriate solid media. Refrigerated (2-8°C): up to 14 days. Frozen at -80°C in glycerol stock: long-term storage up to 2 years. Purified DNA: stable at -20°C for 1 year or -80°C indefinitely.
- Hämolyse max.
- 0
- Lipämie max.
- 0
- Ikterus max.
- 0
- Bearbeitungszeit
- 48–168 Stunden
- Anordnung
- routine
Was ist diese Untersuchung?
Die bakterielle Vollgenom-Sequenzierung (WGS = Whole Genome Sequencing) ist eine hochmoderne Labormethode, die die vollständige Erbinformation (das Genom) eines Bakteriums entschlüsselt. Anders als bei älteren Methoden, die nur einzelne Gene analysieren, wird bei dieser Untersuchung das gesamte Erbmaterial des isolierten Bakteriums gelesen und ausgewertet. Dies ermöglicht eine umfassende Charakterisierung des Erregers.
Wie läuft die Untersuchung ab?
Zunächst wird das Bakterium aus einer Patientenprobe (z.B. Blut, Urin, Wundabstrich) im Labor kultiviert. Aus dieser Bakterienkultur wird dann die gesamte DNA isoliert. Mit speziellen Sequenziergeräten wird die Reihenfolge der Bausteine (Nukleotide) der Bakterien-DNA vollständig bestimmt. Computerprogramme analysieren anschließend die gewonnenen Daten und erstellen eine vollständige genetische Beschreibung des Bakteriums.
Warum wird diese Untersuchung durchgeführt?
Diese Untersuchung wird in mehreren Situationen eingesetzt: Bei schweren oder wiederkehrenden Infektionen, wenn Standardtherapien nicht anschlagen, bei Ausbrüchen von Infektionen in Krankenhäusern oder Gemeinschaften, zur Identifizierung von Antibiotikaresistenzen und zur Unterscheidung verschiedener Bakterienstämme. Sie liefert wesentlich detailliertere Informationen als herkömmliche mikrobiologische Methoden.
Was zeigt das Ergebnis?
Das Ergebnis zeigt die vollständige genetische Zusammensetzung des untersuchten Bakteriums. Dazu gehören Informationen über: alle vorhandenen Antibiotikaresistenzgene, Virulenzfaktoren (Gene, die die Krankheitskraft bestimmen), den genauen Bakterienstamm und seine Verwandtschaft zu anderen Stämmen, sowie genetische Marker, die bei der Nachverfolgung von Infektionsketten helfen können.
Reference range
Interpretive report provided. Results expressed as identified organism(s), sequence type, resistance genes, virulence factors, and phylogenetic relationship when applicable. No quantitative reference range applies; qualitative interpretation only.N/A
No special patient preparation required. Specimen collection should occur prior to initiation of antimicrobial therapy whenever possible to maximize recovery of viable organisms and sequence yield.
Clinical interpretation
How abnormal results are interpreted and what conditions they suggest.
Die klinische Bedeutung der bakterielle Vollgenom-Sequenzierung ist erheblich. Sie ermöglicht eine präzise Diagnose und personalisierte Therapieauswahl, besonders bei Infektionen mit resistenten Erregern. Die Methode unterstützt die Infektionskontrolle durch Nachverfolgung von Ausbrüchen und Identifizierung der Übertragungswege. Sie trägt zur Verbesserung der Patientenversorgung bei, indem sie unnötige Antibiotikatherapien verhindert und die Wirksamkeit der Behandlung erhöht. Zudem trägt sie zur Surveillance von Antibiotikaresistenzen auf populationsbasierter Ebene bei.
Häufige Fragen
Wie lange dauert das Ergebnis?
Ist die Untersuchung schmerzhaft?
Wer profitiert am meisten von dieser Untersuchung?
Was passiert nach dem Ergebnis?
Kann die Untersuchung bei allen Bakterien durchgeführt werden?
Quellen
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Diese Informationen dienen ausschließlich Bildungszwecken und ersetzen keinen professionellen medizinischen Rat, keine Diagnose und keine Behandlung.
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