16S rRNA遺伝子シークエンシング検査

公開:2026年8月9日更新:2026年8月16日

標準的な培養法では特定できない細菌を、その遺伝子情報の塩基配列を解析して同定する分子検査です。

クイックサマリー

["{\"検査室での培養では増殖が難しい、あるいは不可能な細菌を同定するために遺伝子シークエンシングを利用します\",\"標準的な検査が陰性または決め手に欠ける場合に、感染症の診断を助けます\",\"1つの検体から複数の細菌種を検出できることがあります\",\"結果が出るまで通常の培養より時間がかかります（数日から数週間）\",\"血液、組織、体液、無菌的な体内部位の検体に有用です\"}"]

WellAlly編集チームが医学的にレビュー済み最終レビュー日：2026年8月16日編集方針

要点一覧

LOINC: 66885-5
略号: 16SRRNA
類義語: Bacteria identified 16S rRNA Spec Seq
カテゴリ: 生化学
検体: serum
容器: Sterile, DNA-free, nuclease-free collection tube (e.g., cryovial or sterile screw-cap microcentrifuge tube). For serum: red-top or serum separator tube (SST) free of preservatives. Tubes should be properly labeled with patient identifiers, specimen source, and collection date/time.
単位: N/A
絶食: false
対象集団: 成人
性別: all
年齢範囲: ≥ 0 歳
検査方法: sequencing
CPT: 87153
SNOMED: 104377003
検体量: Minimum 1 mL of serum. Optimal volume 1-2 mL for adequate bacterial DNA extraction and analysis.
安定性: Serum should be processed within 2 hours of collection. Refrigerate at 2-8°C if processing is delayed beyond 2 hours. Frozen specimens stable at -20°C for up to 30 days; for longer storage, maintain at -70°C to -80°C. Avoid repeated freeze-thaw cycles as DNA degradation may compromise detection sensitivity.
溶血（最大）: 500
脂肪血症（最大）: 1000
黄疸（最大）: 500
TAT: 48–168 時間
検査依頼: routine

この検査はどのようなものですか？

16S rRNA遺伝子シークエンシング検査は、細菌の遺伝子情報を解析して細菌を同定する高度な分子検査です。16S rRNA遺伝子は細菌のリボソームの構成要素で、細菌の種類ごとに固有の遺伝子配列を含んでいます。細菌を実験室で培養する必要がある従来の培養法とは異なり、この検査では検体から直接、細菌の遺伝暗号を読み取ることで細菌を検出・同定することができます。

検査はどのように行われますか？

体内から検体を採取します（血液、組織、体液、その他の無菌的部位など）。実験室で技師が検体から細菌の遺伝子物質（DNA）を抽出します。次に16S rRNA遺伝子の領域を増幅し、シークエンシング（塩基配列の解読）を行います。得られた遺伝子配列を、既知の細菌DNAのデータベースと比較して、どのような微生物が存在するかを同定します。

この検査はどのような場合に必要ですか？

医師は次のような場合にこの検査を指示することがあります。感染の徴候があるにもかかわらず標準的な細菌培養で何も増殖しなかった場合、重篤な感染症があり迅速な同定が必要な場合、複数の細菌種が関与している疑いがある場合、標準的な実験室条件では増殖が難しい、あるいは不可能な微生物による感染症の場合、または培養結果に影響を与える可能性のある抗菌薬を使用していた場合などです。

Reference range

Not Detected - No bacterial DNA identified in the specimen. Positive results are reported with bacterial genus and species identification when sequence match criteria are met (typically ≥99% sequence identity and ≥500 base pairs).N/A

検体: serum

No special patient preparation required. Specimen should be collected prior to initiation of antimicrobial therapy whenever possible. For serum specimens, collect before antibiotic administration to maximize pathogen detection. Inform the laboratory of current or recent antimicrobial use.

Clinical interpretation

How abnormal results are interpreted and what conditions they suggest.

◆Associated findings1

よくある質問

結果が出るまでどのくらいかかりますか？

結果は通常3〜7日で出ますが、場合によっては最大2〜4週間かかることがあります。遺伝子シークエンシングと解析は複雑なため、標準的な細菌培養よりも時間がかかります。

この検査は通常の細菌培養より優れていますか？

必ずしも優れているわけではなく、補完的な関係にあります。標準的な培養はより迅速で、抗菌薬への感受性を調べることができる生きた細菌が得られるため、第一選択の方法として用いられます。16S rRNAシークエンシングは、培養がうまくいかない場合や実施できない場合に用いられます。

この検査ですべての種類の細菌を検出できますか？

この検査はほとんどの一般的な細菌を検出しますが、すべての菌種を同定できるわけではありません。一部の細菌は16S rRNA配列が非常に似ているため、正確な同定が難しいことがあります。また、ウイルス、真菌、寄生虫は検出できない場合があります。

この検査でどの抗菌薬が効くかわかりますか？

直接的にはわかりません。細菌種の同定はできますが、抗菌薬感受性試験には通常、細菌を培養して増殖させる必要があります。医師は同定結果に加え、臨床的な判断やその他の入手可能な情報を総合して適切な治療を選択します。

この検査は安全ですか？

検査自体は安全です。安全性は主に検体の採取方法（採血、組織生検など）によって決まり、検査室での検査そのものによるものではありません。

この情報は教育目的のみを目的としており、専門的な医学的アドバイス、診断、または治療の代替とはなりません。

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