细菌全基因组基因岛测序

发布:2026年8月9日更新:2026年8月16日

细菌全基因组测序是一种先进的分子检测技术，通过测定细菌的全部遗传物质（DNA）序列，来鉴定细菌种类、发现耐药基因并追踪感染来源。

摘要速览

{该测试可精确识别细菌种类和基因特征,能检测细菌是否携带耐药基因，帮助选择有效抗生素,可用于追踪感染来源和控制医院内感染暴发,样本通常为血液或其他体液中的细菌分离株,检测结果通常需要数天至数周时间}

医学审核:WellAlly 编辑团队最后审核 2026年8月16日编辑政策

关键信息一览

LOINC: 90246-0
简码: BACWGS
别名: Bacterial whole genome Islt-Seq
类别: 生化
样本: whole-blood
采血管: Pure culture isolate on solid agar plate (e.g., blood agar, chocolate agar, MacConkey agar, tryptic soy agar) or in liquid broth (e.g., thioglycollate, brain heart infusion). Isolates should be submitted on appropriate transport medium in leak-proof, biohazard-compliant container (Category B shipping per IATA regulations).
单位: N/A
是否空腹: 否
适用人群: 成人
性别: all
年龄范围: 0–120 岁
检测方法: sequencing
CPT: 87900
SNOMED: 44750004
标本量: A visible pure colony or loopful of organism (approximately 10^6 to 10^8 CFU) from a fresh culture (18-24 hours growth); minimum one isolated colony required. For liquid media, minimum 1 mL of turbid broth culture.
标本稳定性: Room temperature: viable for up to 7 days on appropriate solid media. Refrigerated (2-8°C): up to 14 days. Frozen at -80°C in glycerol stock: long-term storage up to 2 years. Purified DNA: stable at -20°C for 1 year or -80°C indefinitely.
溶血上限: 0
脂血上限: 0
黄疸上限: 0
报告时间: 48–168 小时
医嘱频率: routine

什么是细菌全基因组测序？

细菌全基因组测序（WGS）是一种高科技检测方法，能够读取细菌体内的全部遗传信息（DNA序列）。与传统的细菌鉴定方法相比，全基因组测序可以提供更详细、更准确的细菌特征信息，包括细菌的具体种类、是否携带致病基因、是否对某些抗生素具有耐药性等。

为什么需要这项检查？

医生可能建议进行细菌全基因组测序的主要原因包括：1）准确鉴定难以用常规方法识别的细菌；2）了解感染的细菌是否携带耐药基因，以便选择最合适的抗生素治疗；3）当出现医院内感染聚集时，帮助追踪感染来源和传播途径；4）研究某些特殊细菌的致病机制。

检查是如何进行的？

首先，医护人员会从患者身上采集样本（如血液、脑脊液、组织样本等），然后在实验室中培养并分离出细菌。从培养的细菌中提取DNA，利用测序仪对细菌的全部基因组DNA进行测序，最后通过计算机分析比对数据库中的信息，得出详细的细菌基因特征报告。

检查结果意味着什么？

检查结果会显示细菌的精确种类、所有的基因信息以及是否携带耐药基因或毒力因子。如果检测到耐药基因，医生可以据此选择更有效的抗生素；如果发现致病性基因，可能提示感染的严重程度。测序结果还可用于判断不同患者之间的细菌是否来自同一来源，这对控制感染暴发非常重要。

这项检查有什么局限性？

全基因组测序虽然信息量很大，但也有一定局限性：检测时间相对较长（通常需要数天到数周）；检测成本较高；检测结果需要专业人员进行解读；测序结果可能发现一些意义不明的基因变异，需要进一步研究。此外，该检查主要针对细菌DNA，无法直接检测病毒或真菌感染。

Reference range

Interpretive report provided. Results expressed as identified organism(s), sequence type, resistance genes, virulence factors, and phylogenetic relationship when applicable. No quantitative reference range applies; qualitative interpretation only.N/A

标本类型: whole-blood

No special patient preparation required. Specimen collection should occur prior to initiation of antimicrobial therapy whenever possible to maximize recovery of viable organisms and sequence yield.

Clinical interpretation

How abnormal results are interpreted and what conditions they suggest.

细菌全基因组测序在临床感染性疾病诊疗中具有重要价值。它能够：1）精确鉴定病原菌种类，特别是对难以培养或鉴定的细菌；2）预测细菌对抗生素的敏感性或耐药性，指导临床精准用药，减少抗生素滥用；3）在医院感染暴发调查中进行菌株分型，判断是否为同一来源的感染；4）为公共卫生监测提供分子水平的证据，帮助控制传染病流行。

常见问题

这项检查需要空腹吗？

细菌全基因组测序的样本采集是否需要空腹，取决于采集的样本类型。如果是血液样本，通常不需要空腹；如果是其他体液或组织样本，请遵循医护人员的具体指导。

检查需要多长时间出结果？

细菌全基因组测序是一项复杂的技术，从样本采集到出具最终报告通常需要1-3周时间。具体时间取决于实验室的设备条件、样本中细菌的数量以及需要分析的内容复杂程度。

全基因组测序和普通细菌培养有什么区别？

普通细菌培养只能告诉我们细菌能否生长和初步鉴定种类，而全基因组测序可以读取细菌的完整遗传信息。简单来说，培养像是看一件衣服的外观，而全基因组测序像是查看这件衣服的完整设计图纸，后者能提供更详细、更精确的信息。

这项检查有风险吗？

检查本身的风险主要来自于样本采集环节。例如，静脉采血可能导致轻微疼痛或淤青，腰椎穿刺（获取脑脊液）可能有轻微头痛风险。但这些风险都很小，医护人员会采取相应措施将风险降到最低。

检查结果是否会被用于其他目的？

细菌全基因组测序的结果在匿名化处理后，可用于公共卫生监测、疾病预防控制中心进行传染病监测和研究。医生会将检测结果用于指导您的治疗，相关信息会作为您病历的一部分进行保密管理。

参考资料

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